Biól. Ricardo Meléndez Hernández Coord. Laboratorio de Citogenética Coord. Laboratorio de Citogenética PRIMEROS DESCUBRIMIENTOS 1866 Las Leyes de Mendel La Doble Hélice del DNA 1953 ERA DEL PRE BANDEO ERA DEL PRE‐BANDEO Cariotipo Humano de 46 cromosomas 1956 Bandeo de los Cromosomas ERA DEL BANDEO CROMOSÓMICO ERA DEL FISH 1968 Primeras secuencias simples por Hibridación in situ 1981 Hibridación in situ por Fluorescencia 1988 1991 Suplemento del FISH en el ISCN Suplemento del FISH en el ISCN M‐FISH y SKY 1996 Changes in Cytogenetic Technology over Decades Ledbetter D. N Engl J Med 2008;10.1056/NEJMe0806570 HIBRIDACION IN SITU CON HIBRIDACION IN SITU FLUORESCENCIA (FISH) FLUORESCENCIA (FISH) Técnica auxiliar o complementaria. complementaria. Casos donde se desea acelerar el resultado antes del cariotipo cariotipo. p . Casos de difícil interpretación y diagnóstico diagnóstico.. Resolución espacial precisa de las estructuras morfológicas y genómicas. genómicas. Muestra Desnaturalización de DNA y de sonda complementaria DNA T A C T T A T G A A U A C U U A T G A A Sonda Sonda U A C U U A U G A A U A C U U A U G A A U A C U U A T G A A Fluorocromo U A C U U A T G A A T A C T T A T G A A 9 Secuencias Repetitivas 21 Y DNA satélite Centrómeros Acrocéntricos DNA satélite R. pericentromérica 1, 3 y 9 Satélite III 1q12, 15p11.2, Yq12 q , p , q Telomérico pter y qter TTAGGG 3 a 20 kb Repetidos Asociados a Telomero TARs 100 a 300 kb Secuencia Subtelomérica 21 q22.13‐q22.2 Inserciones >3 Mb Sonda Problema Sonda Control Citogenética en Interfase (Cremer y cols, 1986) Normal Aneuploidia Duplicación Deleción Amplificación Poliploidia APLICACIONES AREA REPRODUCCIÓN GENÉTICA PEDIATRÍA GINECOLOGÍA NEUROLOGÍA DIAGNOSTICO PRENATAL Y POSNATAL ONCOLOGÍA Infertilidad / Esterilidad Muestra Núcleos / Metafases Síndromes í de Microdeleción Malformaciones congénitas Diferenciación sexual Retardo mental/ desarrollo Esperma, Esperma blastómero, cuerpo polar 5,000 000 10,000 Sangre periférica 50 / 10 100 / 25 Líquido Amniótico Vellos. Coriales 50 / 10 200 / 25 Tumores sólidos en cultivo Tejido Embebido en parafina 40-60 100 Médula Ósea Tejido linfático 100 / 10 200 / 25 Células de descamación anogenital/Buca l 1,000 Edad Materna Avanzada US anormal Marc. Séricos Alterados Sarcomas HEMATO-ONCOLOGÍA Leucemias / Linfomas Tratamto. postransplante ONCOLOGÍA REPRODUCTIVA Cáncer Reproductivo: mama, ovario, próstata, cervical 18 cen X cen Y cen FISH con sondas centroméricas para los cromosomas X (verde) e Y (rojo) y como control sonda centromérica para el 18 (aqua) en tejido testicular. 4p‐ 4p Cortesía Biól. Karem Nieto, HGM PAPÁ: t(5;8) www.pediatriabasadaenpruebas.com HIJO Exploración física: Desproporción entre cabeza y cuerpo, cráneo asimétrico, fontanela anterior amplia, cabello escaso, frente prominente; cara con hipoplasia del tercio medio facial, fisuras palpebrales oblicuas, nariz bulbosa, boca con paladar anterior alto y ojival, implantación baja de pabellones auriculares. Cariotipo: 46,XY,dup(21)(q22.13q22.2) FISH: 46,XY.ish21q22.13‐q22.2(D21S259,D21S341,D21S342x3) TÉCNICAS ORDINARIAS EN DIAGNÓSTICO PRENATAL Ó Cariotipo GTG MLPA QF--PCR QF Genética Prenatal FastFISH FastFISH FISH Esencial en el manejo clínico del embarazo. Ofrece a las madres con alto riesgo, g conocer si su bebé tiene un cariotipo anormal en el primer (BVC = 10-12 sdg) o segundo trimestre (LA = 15 sdg ) (Wilson, et al, 2005). No obstante, la fecha de entrega de un resultado se da entre los 7 y 14 días después de la toma. La demanda es cada vez mayor. Se requiere de la implementacion de nuevas técnicas que sustente los diversos aspectos del costo-beneficio. Weise & Liehr, 2008 RESULTADOS DE FISH PRENATAL Un total de 115 muestras procesadas. De ellas, 25 han sido POSITIVAS (22%): - 47,N,+21 47 N +21 = 15 (uno gemelar) - 47,N,+18 = 6 (uno aparentemente en mosaico) - 47,N,+13 = 1 - 45,X = 1 - Sx. DiGeorge = 1 (46,XX)** q y q q34 = 1 [[46,XX,t(13;14)(q32.3;32.1)] , , ( ; )(q ; )] - 13q14 Existe casi un 100 100% % de concordancia entre los resultados de FISH y su cariotipo, a excepción del caso con Sx Sx.. DiGeorge DiGeorge*,, el cual correspondió a una microdeleción no perceptible en el cariotipo cariotipo.. DIAGNÓSTICO PRENATAL • • • • Paciente i d 41 años. de ñ 17 sdg. Referida para amniocentesis por EMA. Sin antecedentes heredo‐familiares. mos 46,XY,i(20)(q10)[38]/46,XY[44] 5 cultivos primarios Confirmación por estudio de FISH Técnicas Moleculares Aspirado de Médula Ósea Médula Ósea TToma de d Sangre Periférica MO.33.06 RRL 55 años CGL Cariotipo 46,XY,t(9;22)(q34;11) FISH.28.06 Sonda t(9;22) Positivo (100%) SP.19.05 JGGL (19 años) APML‐M3 con 46,XY,t(15;17)[14]/46,XY[11] FISH.18.05 sonda t(15;17) POSITIVO (89.8%) MO.43.06 TGCR 53 años Hipoplasia Medular Cariotipo: Sin crecimiento FISH.33.06 sonda del 7(q31): Positivo (12.1%) FISH.34.06 sonda del 5(q31): Positivo (7.8%) MO.34.06 MPV 77 años ALL Cariotipo: Hipodiploide[3]/47,XY, Cariotipo: Hipodiploide[3]/47,XY,+8[2]/46,XY[20] 8[2]/46,XY[20] FISH.29.06 Sonda t(8;21) Negativo, pero con 3 señales para cromosoma 8 (3.8%) Tejido embebidos en Parafina CaMama Her2Neu Mt dunr Ahnl ` qb` cnqdr dm B` mbdq qBdq quhb` k Prueba para Cancer asociado a VPH basado en FISH, FHACT™ 2p15 2p15ff ` m` mbh bh̀ ' qnin( f ` m` mbh bh̀ cd l ` sdqh h̀ k dmkdr hnmdr oqdb` mbdqnr ` r Bdm6' r nmc` bnmsqnkbnl n hmchb` cnq sdl oq` mn cd oqdf qdr hđm 4o04f ` m` mbh̀ x 1/ p02f ` m` mbh̀ qdonqs` cn dm kdr hnmdr oqdb` mbdqnr ` r x b` mbdqnr ` r x dm nsqnr b b` mbdqdr q qdk` bhnm` cnr ` UOG UOG @mnf dmhs` k9bdquhw+ut ku` +u` f hm` +` mn+odmd B` ady` .bt dkkn9anb` +kdmf t ` +nqnè qćmf dn+ ` l ćf c` k̀ r + b` uhc` c m` r ` k+l t bnr ` r qdr ohq` snqh̀ r - Mt dunr Ahnl ` qb` cnqdr dm B` mbdq qBdq quhb` k Prueba para Cancer asociado a VPH basado en FISH, FHACT™ Persistencia Infección VPH VPH Anormal + Citología Inestabilidad genómica •Buena Correlación Biopsia y FISH 90% con regresión 10% progresan a un mayor grado e incrementan su riesgo para cáncer. •FHACT™ => Ayuda clasificación pacientes con LICE Hmbkt xd du` kt ` bhđmbnmEG@BSSL 2p151/ p02 4o04Bdm6 Patrón de señalización normal Patrón de señalización anormal COD-FISH Müller y cols,1997 Citogenética Convencional y Molecular Bandeo GTG 450 B y alta resolución Análisis de todo el genóma Dificultad en identificar cromosomas marcadores pequeños Falla en crecimiento (médula osea, tumores) o amniocentesis tardía Microdeleciones o rearreglos sutiles <5Mb Las metafases no siempre representan la población celular l l ttotal t l Painting FISH Tinción completa FISH en interfase CGH M-FISH o SKY M-FISH M FISH o SKY CGH (constitutivo o linea en mosaico >30%) FISH en interfase O CGH Sondas de secuencia única (locus específico y subteloméricas) Citogenética Cit éti en interfase Identificación específica de una parte del genoma No se detectan inversiones e inserciones <3Mb FISH Multicolor Identificación rápida de alteraciones numéricas No identifica alteraciones esctructurales sin conocimiento previo CGH Ganancias o perdidas en todo el genoma No se identifican rearreglos balanceados aCGH Cromosomas marcadores o No se detectan inserciones <3Mb aCGH VENTAJAS:: VENTAJAS Resultados rápidos (6‐72 hrs). Fácil de realizar e interpretar. Fácil de implementar, gran estabilidad y duradera. Alta sensibilidad y especificidad p ((95‐98%). ) Aplica a cualquier tejido (sangre, médula ósea, tumores sólidos, líquido amniótico, etc.). No requiere de cromosomas metafásicos. Detecta: a) deleciones b) translocaciones c) marcadores d) rearreglos complejos, etc. Mayor demanda => menor costo y mayor beneficio. Mayor información de eventos específicos con gran valor pronóstico, diagnóstico y de seguimiento. DESVENTAJAS:: DESVENTAJAS Trisomía 8 en mosaico No reemplaza a la técnica citogenética clásica; todavia es una herramienta auxiliar de ella. E Está tá limitado li it d solo l a algunos l cuantos t segmentos o regiones cromosómicas, aunque muy útil para cromosomas totales. No descarta la p presencia de mosaicismo bajo. Requiere de personal altamente calificado. Por lo general requiere de un prescedente clínico. í La citogenética continúa siendo una disciplina de confianza para el diagnóstico de las diferentes patologías. patologías El FISH brinda al grupo médico apoyo a muchas de las explicaciones sobre las diferentes manifestaciones clínicas de un individuo y sus descendientes. Ante la leve sospecha de un probable mosaico somático o gonadal, existen otros tejidos accesibles para su estudio cromosómico. La infraestructura y el apoyo multidisciplinario son clave para el abordaje del paciente a través de las diferentes metodologías de la genética clínica. El citogenetista debe ser capaz de confiar en su intuición profesional y en la resolución de un problema biológico. GRACIAS!
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