IUCS, Fundación H. A. Barceló Facultad de Medicina Bioquímica – Inmunología – Nutrición CUESTIONARIO GUÍA ENZIMAS 1. Defina los siguientes términos: a) Catalizador d) Cofactor g) Holoenzima b) Enzima e) Coenzima h) Apoenzima c) Sustrato y producto f) Grupo prostético i) Inhibidor 2. Dé algunos ejemplos de vitaminas, coenzimas y minerales que sean importantes en las reacciones enzimáticas. 3. Explique por qué una enzima cataliza una reacción química. 4. Determine la clase de enzima que cataliza cada una de las reacciones siguientes: 5. En relación con el siguiente gráfico: a. Explique qué información proporciona el siguiente gráfico. b. ¿Cuáles son los parámetros cinéticos de una enzima con una cinética de Michaelis-Menten? c. Señale en el grafico KM y V max. d. Realice un gráfico doble recíproco (LinneweaverBurke) e indique KM y V max 6. ¿Qué significado tienen los parámetros cinéticos KM y V max? 7. Discuta cómo afectan los cambios de pH a la actividad enzimática. 1 IUCS, Fundación H. A. Barceló Facultad de Medicina Bioquímica – Inmunología – Nutrición 8. En el siguiente gráfico, se muestran los pH óptimos de tres enzimas ¿Qué puede decir al respecto? Enzima 1 Enzima 2 Enzima 3 9. Explique cuál es la influencia de las variaciones de temperatura sobre las velocidades de reacción enzimática. a. Dibuje un gráfico de la velocidad de reacción en función de la temperatura explicando qué pasa a baja temperatura y alta temperatura. b. ¿Qué es la temperara óptima? 10. Defina inhibición enzimática y explique en que se basa cada tipo de inhibición: a. Irreversible b. Reversible: Competitiva, no competitiva, acompetitiva 11. Distinga entre inhibición enzimática e inactivación enzimática. 12. Se quiere determinar los parámetros cinéticos de una enzima que se comporta según el modelo de MichaelisMenten, en ausencia y en presencia de un inhibidor enzimático. Se obtuvo el siguiente gráfico. a. ¿Cómo calcularía los parámetros cinéticos a partir del gráfico? ¿Qué valor calcula para los K M y las V máx? b. Indique cuál recta corresponde a la reacción en ausencia (control) o presencia de dos concentraciones diferentes de un inhibidor I (I1, I2). Considere [I2] > [I1]. c. ¿Qué tipo de inhibición ocurre? 13. Completar las siguientes frases: a. La región de la enzima que debe interaccionar el sustrato se llama …………….. b. La especie química de vida corta que se forma después de que la enzima y el sustrato interaccionen se llama ……………………………………. c. Debido a su estructura, un inhibidor …………………. se une al centro activo de una enzima. d. Un inhibidor que no altera la K M de una enzima es un inhibidor de tipo……………………….. e. A mayor valor de K M, ……………. es la afinidad de una enzima por su sustrato. 2 IUCS, Fundación H. A. Barceló Facultad de Medicina Bioquímica – Inmunología – Nutrición 14. Indique las afirmaciones correctas y reescriba correctamente aquellas que considere falsas: a. Una enzima presenta regulación alostérica cuando distintas sustancias compiten con el sustrato a nivel del centro activo. b. Se dice que una enzima se regula covalentemente cuando su actividad es modificada por la unión de ciertos grupos químicos a residuos de aminoácidos. c. Hablamos de zimógenos cuando una enzima presenta distintas estructuras moleculares que catalizan la misma reacción. d. La inducción o represión genética permite modificar la actividad de una enzima haciéndola más o menos activa, respectivamente. e. La presencia de isoenzimas junto con la compartimentalización celular permiten establecer un mecanismo eficiente de regulación enzimática. 15. Los siguientes párrafos corresponden a una variedad de procesos bioquímicos celulares. Para cada caso, indique el/los mecanismos de regulación que estarían implicados. Justifique su elección y describa de manera sencilla, su mecanismo de acción. a) El proceso de la coagulación implica toda una serie de reacciones enzimáticas encadenadas: un par de moléculas iniciadoras activan por proteólisis un número algo mayor de otras moléculas, las que a su vez activan, nuevamente por proteólisis, un número aún mayor de otras moléculas. b) …en el metabolismo del glucógeno hepático, el control definitivo de la glucógeno fosforilasa vendría dado por la regulación recíproca de las actividades de la proteína-fosfatasa y la fosforilasa quinasa… c) La velocidad del ciclo de Krebs se controla continuamente para cumplir con las necesidades energéticas exactas de la célula. …la isocitrato deshidrogenasa, enzima clave de la vía, es estimulada por la presencia de ADP, que aumenta la afinidad de la enzima por el sustrato. Por contrario, el NADH inhibe la enzima por el desplazamiento directo de NAD+ … d) Los receptores para los activadores de la proliferación de peroxisomas (PPAR) actúan como receptores nucleares que tras la unión de su ligando funcionan como factores de trascripción. El mecanismo preciso a través del cual los ácidos grasos poliinsaturados ω-3 mejoran el metabolismo de las grasas aún no está del todo elucidado, si bien se sugieren que su acción está mediada por los PPAR. ...se observó una significativa disminución en los niveles de TAG circulantes en animales de experimentación que recibieron EPA en su dieta. EPA se asoció a la represión de genes como acetil-CoA carboxilasa y ácido grasos sintetasa hepática, enzimas involucradas en la síntesis de ácidos grasos. 3 IUCS, Fundación H. A. Barceló Facultad de Medicina Bioquímica – Inmunología – Nutrición 16. Análisis de casos prácticos El metabolismo del etanol se produce fundamentalmente en el hígado en dos pasos: en primer término, el etanol se oxida a acetaldehído por la enzima etanol deshidrogenasa (EDH) que consume NAD+. El acetaldehído es un producto tóxico, sin embargo, dado que normalmente es oxidado por la enzima aldehído deshidrogenasa (ADH) a acetato, no se observan signos de toxicidad. El Metanol también es sustrato de la etanol deshidrogenasa, pero el producto formado que se acumula es muy toxico. EDH Etanol + NAD+ à Acetaldehído + NADH + H+ ADH Acetaldehído + NAD+ à Acetato + NADH + H+ Caso A. A un hombre de 43 años se le prescribió un fármaco para el tratamiento del alcoholismo crónico pero se le advirtió que no consumiera alcohol durante el tratamiento. Este fármaco inhibe en forma irreversible a la enzima aldehído deshidrogenasa y no presenta toxicidad en ausencia de alcohol. El paciente bebió una gran cantidad de etanol en una fiesta y tuvo que ser trasladado al hospital, donde murió esa misma noche. ¿Por qué el fármaco resulto tóxico para este paciente? Caso B. Una persona ingirió vino adulterado con metanol. Posteriormente debió ser hospitalizada. Como parte del tratamiento, el medico le suministró un exceso de etanol. ¿Cuál es el fundame nto de este tratamiento? Caso C. Los orientales son muy sensibles a las bebidas alcohólicas. Esto se debe a que la forma mitocondrial de la enzima aldehído deshidrogenasa de bajo KM esta ausente. Estas personas solo poseen la enzima citosólica de alto KM. Explique la mayor susceptibilidad al alcohol en estos individuos. ¿Qué son entre sí las formas mitocondrial y citosólica de la enzima aldehído deshidrogenasa? 17. Enzimogrilla 1) Capacidad de un enzima para discriminar entre sustratos o ligandos competitivos. 6) Parámetro cinético que depende de la cantidad de enzima presente (2 palabras). 2) Modelo matemático que describe el comportamiento de muchas enzimas, como una dependencia hiperbólica de V versus [sustrato] (2 palabras). 7) Inhibición enzimática que se puede revertir aumentando la concentración de sustrato. 3) Enzimas que tienen diferente estructura proteica y catalizan la misma reacción. 4) Zona de la enzima donde se une el sustrato para transformarse en producto (2 palabras). 5) Parámetro cinético relacionado con la afinidad de la enzima por el sustrato. 8) Inhibición enzimática que no se puede revertir aumentando la concentración de sustrato (2 palabras). 9) Ión inorgánico o coenzima necesaria para la actividad enzimática. 10) Molécula que modula a una enzima, por la unión no covalente, en un sitio distinto del sitio activo (2 palabras) 4
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