1. Ciencia

Nº 4
IBMCP Newsletter
Julio / Octubre 2014
Miembros del IBMCP forman parte del equipo de la UPV que participará
en iGEM 2014, el prestigioso concurso de Biología sintética del MIT
El día 25 de Julio se presentó el equipo de la UPV que en otoño competirá en iGEM, el concurso de Biología
sintética organizado por el Massachusetts Institute of Technology (MIT). El grupo está compuesto por seis
estudiantes de tercer y cuarto curso, dos del Grado en Tecnologías Industriales y cuatro del Grado en
Biotecnología, que cuentan con la ayuda de cuatro investigadores principales y ocho asesores. Los alumnos
han presentado Sexy Plant, un proyecto que propone una estrategia novedosa en el control de plagas en
agricultura, como alternativa a los pesticidas. Se trata de crear una planta sintética capaz de producir y liberar
feromonas sexuales de insectos, y equipadas con un interruptor genético que activa las señales químicas para
generar confusión sexual en determinados momentos, cuando el agricultor así lo decida. José Gavaldá, estudiante
de Biotecnología y miembro del equipo, aportó más detalles: “El siguiente paso es cultivar las plantas modificadas
en las inmediaciones de los campos que se quieren proteger. Para garantizar la bioseguridad, usaremos plantas
no aptas para el consumo, fácilmente identificables (coloreadas) y estériles, de manera que podamos controlar
su dispersión. Qué concentración de feromonas debe producir cada planta y cómo distribuir su presencia en el
campo son otros de los problemas que debemos resolver antes de llegar a Boston”.
iGEM es el acrónimo de International Genetically Engineered Machine, el concurso creado en 2004 como
una competición de verano dirigida a alumnos brillantes. Un año después, el MIT abrió la prueba a equipos
internacionales con el objetivo de impulsar una nueva comunidad de expertos mundiales en este campo.
Diego Orzáez, miembro del Instituto Universitario Mixto de Biología Molecular y Celular de Plantas y uno de los
cuatro investigadores principales del proyecto Valencia_UPV, comentó que “la Biología sintética está de moda.
Existe una eclosión de esta disciplina. Tanto es así que ya se habla de una biología de garaje, un fenómeno
comparable a la informática de garaje que en su día impulsaron Steve Jobs y Bill Gates”. En esta edición, participan
246 equipos de todo el mundo, pero solo 2 son españoles y ambos valencianos. Javier Urchueguía, miembro del
Instituto Universitario de Matemática Pura y Aplicada de la UPV y otro de los investigadores principales del proyecto,
hizo balance de la participación valenciana en el concurso: “En 2006 fuimos los primeros en España que
presentamos un equipo, co-participado con la Universitat de València, y desde entonces hemos acudido a todas las
ediciones que se han celebrado. En 2009, conseguimos un gran éxito con una bacteria que emitía luz a partir de un
impulso eléctrico; quedamos los terceros. En esta ocasión, la UPV quiere volver a intentarlo con un equipo
totalmente propio”. El acto ha contado con la presencia de numerosos representantes institucionales: Victoria
Vivancos, vicerrectora de Alumnado y Extensión Universitaria; Nemesio Fernández, director de la Escuela Técnica
Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural; Jorge García-Serra, director de la Escuela Técnica
Superior de Ingenieros Industriales, y José Pío Beltrán, coordinador del Consejo Superior de Investigaciones
Científicas (CSIC) en la Comunitat Valenciana, entidad que también colabora en el proyecto. Durante los meses de
Julio a Octubre los estudiantes del iGEM han desarrollado la parte wetlab de su proyecto en nuestro centro. En
estos meses habréis visto deambular por el IBMCP a José Gabaldá, Lucía Estellés, Alba Rubert y Alfredo
Quijano, los estudiantes del grado de Biotecnología que forman parte del proyecto. Junto con otros estudiantes y
profesores de Industriales. Supervisados por Marta Vázquez y Estefanía Huet en el laboratorio de Diego Orzáez, el
Equipo iGEM ha trabajado duro para llevar adelante su proyecto. El resultado de su esfuerzo lo podéis ver en:
http://2014.igem.org/Team:Valencia_UPV. Los primeros días de Noviembre defenderán su proyecto en el jamboree
iGEM2014 en Boston, USA. Desde el IBMCP les deseamos mucha suerte!!
Tesis Doctorales
Walter Barrantes: Desarrollo de una genoteca de líneas de introgresión entre Solanum
lycopersicum y Solanum pimpinellifolium utilizando herrramientas genomicas de alto
rendimiento y detección de QTLs implicados en calidad de fruto.
Directores: Antonio J. Monforte y Antonio Granell
Universidad Politécnica de Valencia: 11 de Julio de 2014
Calificación: Sobresaliente Cum laude
Mohamad Abbas: The control of auxin homeostasis through the regulation of IAMT1 by
DELLA proteins.
Directores: Miguel A. Blázquez y David Alabadí
Universidad Politécnica de Valencia: 23 de Julio de 2014
Calificación: Sobresaliente Cum laude
Pilar Rojas Gracia: Identificación de genes que regulan el desarrollo del ovario y el cuajado
del fruto de tomate (Solanum lycopersicum L.).
Directores: José Pío Beltrán y Concepción Gómez Mena
Universidad Politécnica de Valencia: 16 de Octubre de 2014
Calificación: Sobresaliente Cum laude
Laura Campos Beneyto: Metabolitos secundarios de naturaleza fenólica: papel en la
respuesta defensiva de plantas de tomate.
Directores: Mª Purificación Lisón Párraga e Ismael Rodrigo Bravo
Universidad Politécnica de Valencia: 31 de Octubre de 2014
Trabajos Fin de Grado / Master
Adrián Serrano Fernández. Ha realizado el Trabajo Final de Máster en Mejora Genética de
Plantas del COMAV dirigido por José Antonio Navarro y Vicente Pallás.
Sergio Galindo Trigo. Ha realizado el Trabajo Final de Máster en Biotecnología Molecular y
Celular de Plantas del IBMCP dirigido por Jesús A. Sánchez Navarro y Vicente Pallás.
Determinación de la Estructura Primaria del Virus Latente del Clavel e
Identificación de Regiones Reguladoras en el Ciclo de Infección. 17/09/14.
Miryam Pérez Cañamás. Análisis de las Interacciones Moleculares del Supresor del
Silenciamiento por RNA del Virus del Arabesco del Pelargonium. 29/09/14. Directora: Carmen
Hernández.
Mª del Pilar Fajardo Flores. Análisis de determinantes de localización subcelular en el
supresor del silenciamiento por RNA codificado por el virus del arabesco del Pelargonium.
Trabajo de Fin de Grado (Biotecnología). 9 de septiembre de 2014. Directora: Cármen
Hernández.
David Martínez Gabaldón. Aproximaciones para el desarrollo de un vector capaz de inducir
silenciamiento génico en plantas basado en el virus del arabesco del Pelargonium. Trabajo de
Fin de Carrera (Licenciatura en Biotecnología). 3 de julio de 2014. Directora: Cármen
Hernández.
Movilidad
Irene Martínez-Fernández, del grupo de Cristina Ferrándiz, está haciendo una estancia en el
laboratorio de Marcio Alves Ferreira en la Universidad Federal de Río de Janeiro en Brasil.
Estancias de investigadores en el IBMCP
Marta Hernández Carretero se ha incorporado al lab 2.03, para realizar el trabajo fin de carrera
(Ingeniería Agronómica) bajo la dirección de Purificación Lisón e Ismael Rodrigo, en principio hasta
Junio de 2015. Marta es Ingeniera Agrónoma.
Walter Barrantes al finalizar su Tesis Doctoral, regresó a Costa Rica para trabajar como profesor y
mejorador en la Estación Experimental Agricultor Fabio Baudrit de la Univesidad de Costa Rica.
Antonio Bustamante se ha incorporado al lab 1.08 para hacer la tesis doctoral con JM Mulet sobre la
producción de plantas tolerantes al frío (4 años).
Elías Kabbas Piñango se ha incorporado al lab. 2.03 para realizar su Trabajo Final de Carrera bajo la
dirección de Ismael Rodrigo y Mª Purificación Lisón. Elías trabajará en temas relacionados con la
interacción planta-patógeno.
Amrita Ranjan, Postdoctoral fellow under Erasmus Svagata Fellowship for 10 months (September
1st 2014 to July 5th 2015). PhD from Indian Institute of Technology Guwahati. Energy (Renewable
Energy: Biomass to Biofuel). Lab: 0.04, Prof. Pablo Vera.
Anna Adam Artigues, Contrato Gerónimo Forteza: FPA/2014/068. Lab 1.08, Prof. Lynne Yenush.
1-7-2012 a 31-12- 2014. Papel del Trafico en la Homeostasis de Iones y Nutrientes en Levadura y Plantas.
Aída Rodríguez Hernández. México, Inst.Potosino de Investigacion Cientifica y Tecnologica. L 2.06,
Isabel López. Del 06/10/2014 al 10/12/2014.
Licia Albiar García. L 1.08. Lynne Yenush. Duración 3 meses: octubre- diciembre. Prácticas de
Formación Profesional. Instituto Blasco Ibañez.
Rodolfo De La Torre Almaraz viene desde Méjico para caracterizar virus presentes en frutales de
hueso. Estará en el laboratorio de Vicente Pallás del 1 de Noviembre al 15 de Diciembre bajo la
supervisión de J.A. Sanchez-Navarro.
Beilei Wu, del Institute of Plant Protection de la Academia China de Ciencias Agronómicas. Estará en
el lab de Santi Elena como postdoc durante un año. Trabajará en evolución experimental de virus,
especialmente en el papel de las proteínas de choque térmico como chaperonas durante el ciclo de
infección de potyvirus.
Fernando Martínez García, un viejo conocido de la casa que hizo la Tesis con José A. Daròs y Santi
Elena, y que ahora se incorpora como postdoc al laboratorio de Santi. Trabajará en redes de
interacción entre proteínas de potyvirus y del huésped.
Manuel Ferrando Bernal, se ha incorporado al lab de santi Elena como becario JAE-intro y estará
tres meses trabajando en evolución molecular de proteínas con función deaminasa y que pueden
contribuir a hipermutagenizar el genoma viral.
Victor Bello, estudiante de Biotecnología de la Universidad de Salamanca, realizó Practicas
Academicas Externas Curriculares del 23 de Junio al 31 de Julio con Ricardo Flores.
Reyna I. Rojas Martínez viene desde Méjico para conocer el desarrollo de metodologías de detección
para identificación de haplotipos de la bacteria floemática Candidatus liberibacter. Estará en el
laboratorio de Vicente Pallás del 20 al 25 de Octubre bajo la supervisión de F. Aparicio.
Pablo Romero García está realizando su Trabajo Fin de Máster en el lab. 1.01 bajo la dirección
de Concha Gómez Mena y José Pío Beltrán.
Roberta Borges dos Santos de la empresa Fundecitrus (Brasil), está realizando una estancia del 29
de septiembre al 15 de octubre en el laboratorio 0.03 de Leandro Peña para mejorar las técnicas
de cultivo in vitro y transformación de cítricos.
Publicaciones (Julio - Octubre 2014)
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Artículo en
En un artículo publicado en The New York Times (http://www.nytimes.com/?WT.z_jog=1) del
25 de septiembre (sección Science, A Tiny Emissary From the Ancient Past por Carl Zimmer)
se hace referencia a un artículo publicado por Ricardo Flores, Selma Gago-Zachert, Pedro
Serra, Rafael Sanjuán y Santiago F. Elena. El artículo al que se refiere lo podéis encontrar
en:
http://arjournals.annualreviews.org/eprint/aYr8ZVMhKAq3bDej27bV/full/10.1146/annurev-micro-091313-103416
desde donde se puede descargar el PDF.
Libro
Castañeda R, Jorda JL, Díaz-Cabañas MJ, Rives V, Vicente MA, Puche
M, Primo A, Quesada M, Mifsud M, Latorre-García L, López-Gresa MP
Materiales porosos y de alta superficie
ISBN: 9788420561264
NOMBRAMIENTO
A propuesta unánime de la Comisión de Promoción del Profesorado, la UPV
ha resuelto cambiar la condición de Profesor Emérito ad honorem de nuestro
compañero Vicente Conejero Tomás por la de Profesor Emérito (contratado).
¡¡Enhorabuena Vicente!!
Seminarios del IBMCP
18 Julio. Something new to look at: replication of plant viruses in filamentous fungi. Donato Gallitelli.
Universidad de Bari (Italia).
22 Julio. The role of secretory trafficking in differential growt. Rishikesh P. Bhalerao. Umea Plant
Science Centre (UPSC). Umea University. Sweden.
23 Julio. Minimal and ancestral genomes. Arcady Mushegian. NSF Genetic Mechanisms Program
Director (USA).
19 Septiembre. Surprises from Grandmothers' balcony: Genetic analysis of Petunia floral development
reveals limitations of the 'universal' floral ABC model. Michiel Vandenbussche. Laboratoire de
Reproduction et Développement des Plantes, ENS de Lyon (France).
8 Octubre. Descubriendo la función de AtGRDP1, una proteína con un dominio rico en glicinas,
involucrada en la respuesta al estrés en Arabidopsis. Juan Francisco Jiménez Bremont. Instituto
Potosino de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (IPICyT), San Luis de Potosí, México.
17 Octubre. Factores que determinan la multiplicidad de funciones de las hormonas giberelinas.David
Alabadí. IBMCP, Valencia.
31 Octubre. An indigenous landrace of maize supports a functional nitrogen-fixing microbiome. Alan
B. Bennett. Plant Sciences. University of California, Davis, USA.
Asistencia a Congresos y Reuniones Científicas
Natural Products Chemistry Workshop, realizado del 15 al 21
de Agosto en Uganda, y en el que han participado impartiendo
formación Mª Pilar López Gresa y Teresa Caballero.
Ricardo Flores participó como Ponente invitado en el International
Symposium "Cell response to viral infection: search for new therapeutic
targets", organizado por Enrique Villar y patrocinado por la Fundación
Ramón Areces, Salamanca, 26-27 de Marzo de 2014.
- Ponente principal (keynote speaker) en el Symposium "DNA Habitats and its RNA Inhabitants"
organizado por Guenther Witzany y Luis P. Villarreal, Salzburg, Austria, 3-5 July 2014.
- Moderador (chairman) y conferenciante de la sesión "Evolution and Ecology" del "XVI International
Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions", Rhodos, Greece, 6-10 July, 2014.
Pallas, V. 'Ilarviruses of Prunus spp.: diagnosis, genetic diversity and movement within and among plants.'
Tipo de participación: Sesion Plenaria. Congreso: XVI INTERNATIONAL ANNUAL MEETING AND XLI
NATIONAL ANNUAL MEETING OF THE MEXICAN PHYTOPATHOLOGICAL SOCIETY. Lugar de
celebración: Ixtapan de la Sal, Estado de México, México. Fecha: 21 a 25 de Julio , 2014.
De La Torre-Almaraz, R., V. Pallas, J. A. Sánchez-Navarro & R.A. Valverde. 'Detection of Cactus X
virus in prickle pear (Opuntia ficus-indica L.) in Otumba, Mexico. Tipo de participación: Poster. Congreso:
XVI INTERNATIONAL ANNUAL MEETING AND XLI NATIONAL ANNUAL MEETING OF THE MEXICAN
PHYTOPATHOLOGICAL SOCIETY. Lugar de celebración: Ixtapan de la Sal, Estado de México, México.
Fecha: 21 a 25 de Julio , 2014.
De La Torre-Almaraz, R., J. A. Sánchez-Navarro & V. Pallas. 'Molecular characterization of the Prunus
Necrotic Ringspot Virus (PNRSV) in peach (Prunus persica (L.) in the states of Mexico, Moreles and
Puebla) Detection of Cactus X virus in prickle pear (Opuntia ficus-indica L.) in Otumba, Mexico. Tipo de
participación: Poster. Congreso: XVI INTERNATIONAL ANNUAL MEETING AND XLI NATIONAL ANNUAL
MEETING OF THE MEXICAN PHYTOPATHOLOGICAL SOCIETY. Lugar de celebración: Ixtapan de la
Sal, Estado de México, México. Fecha: 21 a 25 de Julio, 2014.
V. Pallas, M. Serra-Soriano & J.A Navarro. 'The intracellular movement of a plant RNA virus'. Tipo de
participación: Sesión Plenaria.pg 9. Congreso: XII NATIONAL CONGRESS OF THE ITALIAN SOCIETY
FOR VIROLOGY. Lugar de celebración: Orvieto, ITALY. Fecha: 22 a 24 de Septiembre, 2014.
Tres de los ganadores de las Olimpiadas Nacionales de Biología realizaron
prácticas en el IBMCP durante el mes de Julio
El IBMCP acogió, del 7 al 11 de julio, a tres de los ganadores de las Olimpiadas Nacionales de
Biología 2014 que solicitaron realizar una estancia entre nosotros con objeto de contacto con los
investigadores y realizar prácticas de laboratorio. En esta iniciativa han colaborado los miembros de
la Comisión de Divulgación así como los responsables de distintos Servicios del Instituto: Susana
Tárraga (Proteómica), Lorena Latorre (Genómica), Javier Forment (Bioinformática), Eugenio
Grau (Secuenciación). Vicente Guardiola (Metabolómica), Alex Atarés (Cultivo in vitro), Isabel
López y Esther Carrera (Cuantificación de Hormonas Vegetales), Victoria Palau y Rafa Martínez
(Invernaderos).
Daniel Aguilar Figueroa, de Cádiz; Gabriel Gomis Cobos, de Madrid; y Óscar García Blay, de
Castellón, han visitado las instalaciones y equipos de que dispone el IBMCP donde, entre otras
cosas, aprendieron técnicas de microscopía, de secuenciación de ADN y de cultivo in vitro de
tejidos de plantas; descubrieron las nuevas técnicas en bioinformática, proteómica, genómica y
metabolómica; visitaron los invernaderos donde observaron diversas especies de plantas
modificadas genéticamente, etc.
Creadas por petición de la UNESCO, la primera Olimpiada Española de Biología se realizó en el
año 2005, promovida por un grupo de profesores de secundaria de las Islas Canarias. En la
actualidad, ya se organizan fases locales en todas las Comunidades Autónomas, en Ceuta y Melilla
y en los centros españoles en el extranjero. Todos los años unos 30 finalistas de la fase nacional
realizan estancias de una semana de duración en diferentes centros del CSIC.
José Pío Beltrán, coordinador institucional del CSIC en la Comunidad Valenciana, destacó en una
nota de prensa el interés que la delegación del CSIC tiene en fomentar las vocaciones científicas
en los más jóvenes. “Y es por eso que organizamos actividades como ConCiencia Sé: Encuentros
entre jóvenes y científicos de excelencia, la visita anual a un centro del Consejo de los jóvenes con
gran talento matemático del programa ESATLMAT, o los Encuentros de Excelencia con científicos
de renombre en el marco de VLC/CAMPUS. Estamos muy contentos de que, gracias a la invitación
de la dirección del IBMCP y a la organización de la Comisión de Divulgación, estos tres jóvenes
excelentes puedan participar durante una semana en el trabajo que se desarrolla en los laboratorios
del IBMCP”.
Gabriel Gomis Cobos, Daniel Aguilar Figueroa y Óscar García Blay
Luis A. Cañas
Grabación de un lipdub en el IBMCP con motivo de la participación
del equipo Valencia-UPV en el iGEM 2014
El día 29 de julio se grabó un lipdub en diversas localizaciones del IBMCP con motivo de la participación
de varios miembros de nuestro Instituto en el concurso iGEM 2014. En las fotografías aparecen todos los
participantes tras la grabación del video. https://www.youtube.com/watch?v=x_uhzKFNBdk
VOLTA A PEU DE LA UPV 2014
Varias chicas del IBMCP participaron en la Volta a Peu de la UPV (2 de octubre de 2014).
De izquierda a derecha: Laura Campos, Cristina Torres, Cecilia Primo, Alba Timón,
Cristina Ferrándiz y Patricia Ballester.
Cristina Ferrándiz
Ocio
Sendero de Calles al Acueducto Romano de la Peña Cortada
LUGAR: Calles (Valencia).
DISTANCIA: 8 Km ida y vuelta.
DURACIÓN: 3 horas (con paradas).
DIFICULTAD: Baja.
DESNIVEL: Unos 400 m.
ÉPOCA: Primavera-Otoño.
El Sendero de la Peña Cortada, es uno de los más espectaculares de toda la Comunidad Valenciana, y es que,
el hecho de caminar por dentro y pasar por encima de un acueducto romano, no es una práctica habitual de todos
los días. Esta ruta se puede realizar desde Calles o desde Chelva. Nosotros la vamos a realizar desde Calles, ya
que es más atractiva desde un punto de vista paisajístico y senderista. Salimos de Valencia por la autovía, dirección
Llíria-Ademuz. A unos 63 Km., cogemos el desvío a Calles, y sin entrar en el pueblo, dejando el puente de entrada a
nuestra izquierda, seguimos recto hasta encontrar a poca distancia el desvío hacia nuestra ruta y aparcamos. Una
pequeña cabaña de madera de información nos indica el inicio de la senda. La senda en principio es un ancho
camino que nos lleva, por debajo de la nueva carretera, hacia nuestro destino. Al poco tiempo nos encontramos con
una fuente, que a la vuelta nos servirá para refrescarnos. Seguimos caminando, y después de una corta bajada
vemos el desvío hacia Torre Castro, mirador privilegiado de toda esta zona, si decidimos subir nuestro tiempo se
alargará, unos 90 minutos, sobre el horario previsto.
El barranco por el que discurre nuestra marcha se va convirtiendo, poco a poco, en una estrecha garganta. El
sendero, acondicionado por unas vallas de madera, nos lleva, cruzando un puente, a la margen izquierda del
barranco y tras una fuerte subida en zig-zag, llegamos a un mirador que nos permite ver por donde hemos subido.
Las vistas son fantásticas. Seguimos adelante y al poco tiempo empezamos a adivinar los túneles del acueducto,
tallados en la misma roca a semejanza del existente cerca de Albarracín. Ascendiendo un poco más por la senda
nos adentramos por los túneles por donde antiguamente discurría el agua. Túneles, ventanas en la roca, espacios
abiertos sobre los precipicios, sin duda un lugar espectacular. Salimos de los túneles y llegamos a la Peña Cortada,
impresionante tajo que le hicieron a la montaña los romanos (o mejor dicho nuestros antepasados). La Peña
Cortada tiene una longitud de unos 50 m, una altura de 25 m y una anchura de unos 2 m. Atravesamos la Peña y
salimos a la parte alta del Acueducto que aquí tiene forma de puente para salvar el Barranco del Gato. El puente
tiene una longitud de unos 36 m, una altura de unos 30 m y una anchura de unos 2 m. La ruta en sí, acaba aquí.
Pero si queremos ver el Puente desde abajo, que aún es más impresionante si cabe, hay que cruzarlo y por un
sendero estrecho y algo aéreo, bajaremos hasta el aparcamiento de los coches que vienen desde Chelva. Desde
allí, por la Rambla de Alcotas, llegaremos fácilmente a su base. Añadir unos 45 minutos más a la excursión.
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