INDICADORES DE GESTIÓN - gicuv

Escuela J. A. Balseiro 2014 - Modelado en Neurociencia
Práctica de Plasticidad
Lucas Mongiat
Melisa Maidana Capitán
Soledad Gonzalo Cogno
Repaso
Repaso
fepsp: Depolarización postsináptica
causada por el flujo de iones hacia
células postsinápticas.
Population Spike: Cambio en el
potencial que resulta de la generación
de disparos de una población de
neuronas.
1) Objetivos de la práctica
 Para cada registro: Calcular la pendiente
del fepsp y el área (population spike),
normalizados al primer pulso.
Registro
100
200
300
400
500
600
Tiempo (ms)
700
800
Registro
100
200
T_pulso2
300
400
500
600
Tiempo (ms)
700
800
Registro
100
200
Cambia registro
a registro
T_pulso2
300
400
500
600
Tiempo (ms)
700
800
Registro
100
200
300
400
500
600
Tiempo (ms)
700
800
Cálculo del área
415
420
Tiempo (ms)
425
Cálculo del área
415
420
Tiempo (ms)
425
Cálculo del área
Área
415
420
Tiempo (ms)
425
Cálculo del área
Área
Population Spike:
Cuantifica cuántas
neuronas granulares
han sido activadas
415
420
Tiempo (ms)
425
Cálculo de la pendiente del fepsp
Área
Pendiente
Population Spike:
Cuantifica cuántas
neuronas granulares
han sido activadas
415
420
Tiempo (ms)
425
Cálculo de la pendiente del fepsp
Área
Pendiente
Pendiente del fepsp:
Cuantifica la
depolarización del
fepsp. Es lineal con
los axones activados.
415
420
Tiempo (ms)
Population Spike:
Cuantifica cuántas
neuronas granulares
han sido activadas
425
Medidas normalizadas al primer pulso
Área 1
Pendiente 1
350
400
Área 2
Pendiente 2
450
500
550
Tiempo (ms)
Pendiente= Pendiente2 / Pendiente1
Área=Área2 / Área1
Para cuantificar, para
un dado T_pulso2, el
efecto de la plasticidad
Rangos temporales para el análisis
100
200
300
400
Tiempo (ms)
500
600
Rangos temporales para el análisis
T_BASELINE_INI
100
200
T_BASELINE_FIN
300
400
Tiempo (ms)
500
600
Rangos temporales para el análisis
T_BASELINE_INI
100
200
T_BASELINE_FIN
300
400
Tiempo (ms)
500
600
T_SLOPE_INI
T_SLOPE_FIN
410
420
Tiempo (ms)
430
T_ANTIPEAK_INI
T_SLOPE_INI
T_SLOPE_FIN
410
420
Tiempo (ms)
430
T_ANTIPEAK_INI
T_SLOPE_INI
T_SLOPE_FIN T_ANTIPEAK_FIN
410
420
Tiempo (ms)
430
T_ANTIPEAK_INI
T_SLOPE_INI
T_SLOPE_FIN T_ANTIPEAK_FIN
T_SPEAK2_FIN
410
420
Tiempo (ms)
430
2) El programa
 analisis.m
 parametros_manuales.m
Abre el file para guardar
los resultados finales
Abre el file para guardar
los resultados finales
Carga en una matriz
todos los registros
Abre el file para guardar
los resultados finales
Carga en una matriz
todos los registros
Indica modo manual o
automático
Abre el file para guardar
los resultados finales
Carga en una matriz
todos los registros
Indica modo manual o
automático
Grafica un dado registro
Abre el file para guardar
los resultados finales
Carga en una matriz
todos los registros
Indica modo manual o
automático
Grafica un dado registro
Windows
Linux
Abre el file para guardar
los resultados finales
Carga en una matriz
todos los registros
Indica modo manual o
automático
Grafica un dado registro
Windows
Linux
Abre la matriz “resultados”
Abre la matriz “resultados”
Normaliza al primer pulso
Abre la matriz “resultados”
Normaliza al primer pulso
Guarda los resultados
correspondientes al
T_pulso2 utilizado
Parámetros_manuales.c
Parámetros_manuales.c
3) Qué hacer: Parte 1
 Graficar un registro utilizando la primera
parte del programa analisis.m.
 Reemplazar en parametros_manuales.m
los valores de tiempo correspondientes al
registro utilizado.
 Correr con manual=1.
3) Qué hacer: Parte 2
 Construir una rutina que calcule el
área y la pendiente.
Área
Pendiente
415
420
Tiempo (ms)
425
¿Cómo calcularía la pendiente?
Pendiente
415
420
Tiempo (ms)
425
¿Cómo calcularía la pendiente?
415
416
417
418
Tiempo (ms)
419
420
¿Cómo calcularía el área?
Área
415
420
Tiempo (ms)
425
¿Cómo calcularía el área?
415
420
Tiempo (ms)
425